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欧洲开放科学云招标要求项目在云中共享数据、工具和工作流

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欧洲开放科学云(EOSC202010月启动了首个数字生命科学项目公开征集活动,该项目旨在在云中共享数据、工具和工作流。EOSC-Life公开征集的项目提案应符合以下一个或多个主题:数据管理、处理和集成以发布到云端;具有互操作性的工具、工作流程并容器化;云部署并资源化。具体来说,项目可以归入以下一个或多个类别:

l  开发数据预处理、共享和搜索的工作流程和工具箱。

l  通过EOSC收集、处理、标准化、FAIR化和存储不同种类的现有数据,例如微生物学、病理学、化学信息学、药物和临床数据。

l  在生命科学领域生成数据集的算法方法。

l  整合各生命科学领域或各研究团体内部的现有数据集和资料库

l  将现有的工作流程迁移到云端,使其符合FAIR数据标准,并整合多个工作流程。

l  元数据的生成和使用,包括自动化项目。

研究技术的进步导致生命科学研究产生的数据量大幅增加。这些数据集,许多来自大规模的筛选项目,超出了使用传统工具处理、共享和分析的范围,而且往往包含的数据宝库超出了最初项目设定的分析范围。因此,有必要在云中提供数据、工具和工作流程,以便在个别项目的原定范围内和范围外,最充分地利用所产生的数据。EOSE本次公开征集项目的目的是支持其他多种项目的发展,帮助实现开发生命科学领域数据和工具的开放数字空间、促进跨学科合作和推动数据密集型研究领域的长期目标实现。该项目的总体目标是开发对生命科学界有用和有影响的工具、数据和工作流程来充实EOSC。

EOSC-Life汇集了13种生物和医学ESFRI研究基础设施,以创建一个开放的数字生物学协作空间。通过在欧洲范围内的云中发布数据和工具,EOSC-Life旨在将大型科学项目的功能带给更广泛的研究社区。EOSC-Life建立了一种新颖的访问模型:通过EOSC,科学家将可以在整个欧洲研究区可用的云环境中直接访问FAIR数据和工具。

来源:欧洲开发科学云

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